Il clima tipico delle zone desertiche è costituito da giornate con temperature molto alte e notti fredde (potendo addirittura scendere sotto lo zero in inverno).
Le precipitazioni sono sparse e comunque concentrate soprattutto nella zona nordorientale del paese. La stagione delle piogge nella Namibia centrale va da Gennaio a metà Aprile, nelle zone più a nord inizia invece un po’ prima. La scarsità delle precipitazioni comporta una quasi totale assenza di acqua superficiale. I pochi corsi d’acqua sono quasi sempre secchi e anche quando raccolgono acqua il loro corso è bloccato dalle dune. Solo lo Swakop e l’Omaruru riescono, occasionalmente, a raggiungere l’Oceano.